Студенты изучают глобальные и региональные исторические процессы и явления в их социокультурных, политических, экономических измерениях, а также их отражение в исторических источниках. Региональный фокус программы предполагает знакомство с процессом формирования Азиатской России в контексте развития Российской империи. Особое внимание уделяется системе управления сибирской окраиной, изучению структуры и персонального состава губернской администрации. Программы дисциплин предусматривают детальное рассмотрение процессов формирования общественной мысли и общественного движения как в Сибири, так и в империи в целом. Отдельный курс, посвященный актуальной проблеме формирования сибирской идентичности, позволяет обучающимся углубиться в проблемы этноконфессионального развития региона.
Глобальный фокус магистерской программы нацелен, во-первых, на изучение тенденций глобализации и деглобализации в мировой истории, во-вторых, на рассмотрение того, как глобальные процессы проявляются и преломляются в локальном (например, в рамках курса «Китайские мигранты на Востоке России в XX – начале XXI века»), и наконец, на знакомство с наиболее актуальными подходами мировой исторической науки. Магистранты-историки учатся использовать в своей исследовательской практике методы исторической антропологии и устной истории, исследований памяти и исторической политики, публичной истории и микроистории, новой политической истории и интеллектуальной истории